Dans le cas de l'éclairage orthoscopique en réflexion, il faut, comme en diascopie, ajouter un polariseur dans l'éclairage Köhler et un analyseur dans le corps du microscope (Fig.6). Il est à noter qu'en épiscopie, le polariseur est d'orientation fixe pour imposer une polarisation rectiligne strictement TE (ou TM) sur la lame semi-réfléchissante de l'illuminateur par réflexion. Ceci est rendu nécessaire car une lame semi-réfléchissante traitée transforme toute polarisation incidente autre que TE ou TM en polarisation elliptique (voir cours de polarisation ou d'ellipsométrie).
L'origine physique du contraste de l'échantillon en lumière polarisée épiscopique peut être dû à des phénomènes de diffusion (dépolarisation) ou aux réflexions sur des matériaux biréfringents ou sur des empilements de couches, biréfringentes pour certaines d'entres-elles (ellipsométrie des empilements de couches minces anisotropes []). La partie étude de cas de ce grain présente quelques exemples d'observation en éclairage orthoscopique épiscopique.